从混合物中分离出相对纯的单组分物质，最常用的是随后的有机合成分离，单组分药物物质的纯化，天然产物的分离，蛋白质纯化等。
（一般按压力分类，但没有固定值限制）常压中低压制备色谱仪（重力驱动）是应用最广泛，最简单的中低压制备色谱仪。
优点：操作简便，方便，不需要购买额外的设备，只需购买玻璃柱和显影剂。
天然产物的分离具有传统优势和使用范围;与TLC直接相关，易于探索条件。
缺点：分离时间长，溶剂回收率差，与环境直接连接，试剂易挥发，污染环境;使用玻璃柱，容易损坏人。
闪蒸介质和低压制备色谱仪，一般压力为0.5-1MPa，使用时压力为0-0.5MPa。
中压中低压制备色谱仪，一般压力1-5MPa，使用时压力0.5-2MPa。
由于上述压力远小于高压，因此可以说快速中低压制备色谱仪和中压中低压制备色谱仪统称为中低压中低压制备色谱仪。
优点：分离效率高于常压色谱;蛋白质纯化的天然传统优势;比高压中低压制备色谱仪经济，仪器要求低，用户可自行安装色谱柱;预填充柱可以提高效率;与TLC有直接关系，TLC可用于快速建立分离方法。
缺点：对于难以分离的物质，不能实现高纯度的分离效果。
由于使用仪器，需要购买某些仪器;对于大规模生产，需要轴向压缩，并且需要模拟移动床色谱系统。
高压中低压制备色谱仪，压力一般在10-30Mpa以下，正常使用压力为5-15MPa。
优点：一次可实现小批量材料的高纯度纯化，柱分离效率高。
缺点：成本远高于中低压制备，至少40％;该柱需要从中低压制备色谱柱生产公司购买，成本高;由于高压操作，仪器损坏概率高，维护成本高;分离方法必须首先在HPLC上进行开发。